本署在二○○一年一共抽查了五万五千多个食物样本，作微生物及化学测试。整体趋势令人满意，整体不合格率连续三年下跌。与同期比较，由一九九九年的百分之零点八及二○○○年的百分之零点七，下降至今年的百分之零点五。
在约一万九千四百个微生物测试中，共有五十三个样本被发现含致病原，不合格率为百分之零点三，而一九九九及二○○○年的不合格率分别为百分零点四及百分之零点三。
在二零零一年，最常见与食物有关的致病原组合是在生蠔中发现的诺沃克类病毒，该病毒亦已逐渐成为令人忧虑的焦点。另一个特别的食物与致病原组合是烧味和卤味含沙门氏菌。由于诺沃克类病毒普遍被认为将于未来十年间，成为主要的食物致病原，国际间对此日益关注。有鉴于此，本署亦已将该病毒测试列为食物监察项目之一，以配合国际发展。
在化学测试方面，共进行了约三万六千多个化学测试。当中发现二百二十一个不合格样本，占百分之零点六。不合格率连续两年下降，一九九九年及二○○○年的不合格率分别为百分之一和百分之零点九。