在訂定基因改造食物標籤的規管架構時，必須考慮多項因素，包括對業界的影響和公眾的關注。

過往的公眾諮詢顯示，公眾大都支持強制性標籤制度，並認為食品中若有任何配料的基因改造物質含量超出閾限值，便應加上標籤。不過，鑑於強制性標籤制度可能促使價格上升一事備受關注，政府進行了一項有關基因改造食物標籤的規管影響評估，結果發現若實施強制性標籤制度，會增加業界的經營成本，特別是中小企。此外，國際間現時在基因改造食物的標籤政策問題上仍未達致共識。在決定是否實施強制性標籤規定前，政府需要業界和其他有關人士的參與並徵詢他們的意見。以回應消費者對產品資料的要求逐漸提升，政府認為在現階段推行基因改造食物自願標籤安排是務實的做法。

把閾限值定於百分之五：

優點

• 國際間現時對基因改造食物標籤的閾限值仍未有共識，各國採納的閾限值各有不同，由千分之九至百分之五不等。因此，把閾限值定於百分之五，可減少對業界帶來的技術問題。
• 食物的生產成本增幅較小。
• 在現階段，這個做法對本地食物業界來說較為切實可行。

缺點

• 對於希望知道食物是否含有更低分量的基因改造物質從而作出知情選擇的消費者而言，這個做法未必能完全滿足他們的要求。

把閾限值定於百分之一：

優點

• 對於希望知道食物是否含有任何基因改造物質從而作出知情選擇的消費者來說，這個做法較能滿足他們的要求。

缺點

• 在現階段，這個做法對本地食物業界來說是較難做到的。
• 在農作物的生產過程中，基因改造和非基因改造的食物原料可能不經意地混在一起的情況，因而這個做法會限制了消費者對專為非基因改造食物市場而種植的食物的選擇。

若食物沒有對應的基因改造品種存在，則不建議使用" 反面標籤" ，以免誤導消費者，這建議與國際做法一致。業界若想知道某種食物是否有對應的基因改造品種存在，可瀏覽聯合國糧食及農業組織(糧農組織)轉基因食品平台。此外，本指引亦不建議使用" 不含基因改造成分" 或類似的標籤( 例如：不含基因改造生物、無基因改造成分等) 等絕對性的字眼，因為這些標籤可能會誤導消費者。由於非基因改造農產品可能會不經意地與基因改造農產品混雜，要真正達到" 不含基因改造成分" ，是極難做到的。

除了上述絕對性字眼的標籤外，業界若想用標籤來表明其產品來自非基因改造來源，須具備證明文件以支持有關聲明。此外，如食物含有多種配料，則食物內所有配料均須來自非基因改造來源，並須具備證明文件，才可作出有關聲明。

《食物及藥物( 成分組合及標籤) 規例》附表4 豁免任何含有單一種配料的食物有關該規例附表3 第2 段的標籤要求。但該規例附表3 第3 段訂明，若任何獲豁免附表3 第2 段的預先包裝食物自發地以配料表標記或標籤( 無論配料是否含基因改造成分) ，則該配料表須符合該規例附表3 的標籤要求。

因此，業界若採用基因改造食物自願標籤指引，含單一種配料的食物，如其基因改造物質的含量達百分之五或以上，應於配料表中以括號在該食物名稱後註明" 基因改造" ，或在配料表加上" 基因改造" 的註腳，並置於當眼位置。這類標籤在各方面均須符合上述所提附表3 中有關預先包裝食物的標記及標籤的規定。